系統樹作成法
(update 2017/04/14)

DDBJのClustalWを使った系統樹の作り方

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１）DDBJのサイトを開き、左のボックスから系統解析・ClustalWをクリック
画面は以前のものですので似たような選択肢を探してください（以下同）
少しずつ現在のものに修正していきます。



２）Version1.83を選ぶ

３）”Sequence”の下にあるボックスからDNAあるいはProteinを選ぶ

４）解析配列データのフィールドに比較したいデータ一式をFASTA形式で入力



５）各パラメータは特にいじらなくてＯＫ

６）”Submit”の下にある”Send to ClustralW”をクリック

７）リンクが切れているのかと思うほど待たされるがゆっくり待つ




８）結果が表示され、Summaryと4種のファイルのダウンロードが可能になる

９）一番下の”Download Bootstrapped Tree File”をクリックして任意の場所に保存


１０）”TreeView”という系統樹を見るためのソフトウエアを
ダウンロードして先ほどの系統樹のファイルを開く
TreeViewのダウンロードはここから


１１）メニューの”Tree”から”Show internal edge labels”を選び
ブートストラップ値を表示させる

上図の左下にある”0.1”と書いてあるスケールバーが必ず表示されていること
これが出ない形式（”Slanted ...”など）を選んではダメ

１２）メニューの”File”から”Save as graphic”で保存する


１３）MSPowerPointなどで開く

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